近几年,南疆三大棉区长绒种植面积的很不稳定(主要是阿克苏地区)，长绒棉总产量从近20万吨下滑至10万吨左右(某机构根据2021年长绒棉棉种的销量推算，今年新疆长绒棉种植面积下滑20%-30%)，与2020/21年度新疆棉花总产量再创新高形成鲜明对比。当然ICAC发布的长绒棉报告显示，2020/21年度全球长绒棉产量为32.75万吨，连续第三年下降，中国、美国、埃及、以色列等长绒棉主要生产国的种植面积、产量都有所下滑。
那么我国稳定长绒棉种植面积的难点在哪？：
一是可利用、可拓展的植棉面积很有限。考虑到长绒棉对温度、日照、热量、降雨等要求非常高，目前仅阿瓦提县及沙雅、巴楚及库尔勒的少数棉区可以种植，再加之阿瓦提棉田需要倒茬、轮休等等，因此长绒棉可开发的植棉面积很有限；
二是长绒棉单产、品质等指标近几年几乎没有取得进展。一方面种子公司研究、繁育推广的重点是细绒棉，长绒棉棉种只是个“副业”；另一方面内地其它棉种公司的长绒棉品种进入新疆受到很多制约；因此长绒棉品质、等级及单产如何提高是稳定长绒棉面积的关键；
三是长绒棉因植株高、棉桃分散、种植不集中导致目前很难实现机械化从种到收，农民种植长绒棉物化成本、人工成本(尤其采收环节)等明显高于细绒棉。虽然近两年长绒棉籽棉销售价高于细绒棉1.5-2.2元/公斤，但因单产低、投入大，因此农民实际收益仍低于细绒棉。阿克苏柯坪县农民认为，只有细绒棉、长绒棉籽棉收购价差高于2.60元/公斤才对长绒棉种植更有利于；
四是长绒棉轧花厂大幅减少，不利于农民采收、就近交售。随着近几年新疆棉区机采棉种植大面积、全方位推开，南疆三大棉区手摘棉轧花厂大部分都进行了升级改造，重点收购、加工机采棉，而长绒棉考虑到保纤维长度、保断裂比强度、颜色级等指标，不适合机采加工；
五是进口美国SJV PIMA棉及埃及吉扎棉等的轮番冲击。从调查来看，2019/20、2020/21年度新疆长绒棉受天气、温度及棉种等多因素影响，336及以下指标的占比较高，而237、137及以上品质的长绒棉则偏低；再加上美国政府对新疆棉花产品实施进口禁令、部分国际服装品牌“碰瓷”新疆棉等原因导致出口欧美日等国的高档纺服订单不得不采用进口长绒棉，美SJV PIMA棉等“乘虚而入”。